60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4929 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  53.49 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  53.26 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  48.39 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  46.74 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  47.31 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  44.58 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  37.36 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  36.99 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  40.24 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.78 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  42.68 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  40.7 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  36.59 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  51.02 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  36.78 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  35.63 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  35.63 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  37.78 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.83 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  35.23 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  35.37 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  34.83 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  30.23 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  30.12 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.95 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  30.68 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  32.22 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  40.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  40.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  32.18 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>