148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4820 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  79.22 
 
 
231 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  73.16 
 
 
231 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  76.42 
 
 
229 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.15 
 
 
238 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  48.71 
 
 
232 aa  244  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  51.75 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.56 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.56 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  50.66 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  50.23 
 
 
229 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.89 
 
 
229 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  49.31 
 
 
229 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  46.43 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  47.44 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.61 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  36.09 
 
 
279 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  35.32 
 
 
237 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.09 
 
 
226 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  33.94 
 
 
222 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  39.65 
 
 
230 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  26.82 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  37.29 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  28.36 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  37.25 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  38.79 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  22.12 
 
 
268 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.37 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  25.81 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  31.51 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  34.03 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  34.48 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  32.71 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  28.02 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  39.36 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
221 aa  52  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  25.53 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  40.4 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  25.53 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  31.93 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  31.93 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  36.56 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  24.19 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  34.17 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  34.07 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.07 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.56 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  31.93 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  34.02 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  47.46 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  31.11 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.78 
 
 
205 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.09 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  34.17 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  35.11 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  34.69 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  36.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  34.78 
 
 
228 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  33 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  34 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  32.67 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  32.67 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  34.07 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  31.46 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  32.23 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  36.05 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  30.4 
 
 
223 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  30.28 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  32 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  32 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  37.21 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  35.14 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  34.23 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  35.14 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  24.07 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  28.69 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  32.18 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  38.1 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  37.23 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  31.96 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>