55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2803 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2803  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 101 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1666  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5040  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5372  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3490  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1476  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  40 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  38.6 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  50 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  51.06 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4803  transcriptional regulator, PadR family  38.89 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  46.94 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  47.92 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  53.49 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  40.43 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  43.4 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 106 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>