More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2601 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2601  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 390 aa  787    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  59.68 
 
 		 381 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  61.68 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  60.32 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  54.17 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  54.43 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  58.62 
 
 		 381 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  57.07 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  56.91 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  56.65 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  54.95 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  55.73 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  53.83 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  54.26 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  52.51 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  52.51 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  53.07 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  51.98 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  52.09 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  52.27 
 
 		 381 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  52.24 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  50.79 
 
 		 380 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  51.85 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  49.07 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  50.66 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  51.6 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  49.07 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  49.34 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  49.07 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.6 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  49.33 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  50.68 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  48.41 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  52.27 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  50.52 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  47.11 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  47.86 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  47.61 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  49.21 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  50.91 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  48.94 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  45.65 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  50.51 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  47.89 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  50.4 
 
 		 379 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  48.67 
 
 		 386 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  50.79 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  50.52 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  48.8 
 
 		 380 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  44.5 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  49.48 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  46.3 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  45.93 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  45.93 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  43.33 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  50.52 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  48.74 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  43.08 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.13 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 379 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  48.55 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  47.89 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.93 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  49.74 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  48.68 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  47.63 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  47.86 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.78 
 
 		 381 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  45.22 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  48.81 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  47.2 
 
 		 383 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  47.37 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  48.16 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  44.27 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  50.95 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  51.05 
 
 		 380 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  45.74 
 
 		 378 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  51.32 
 
 		 380 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  51.31 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15917  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  48.83 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>