More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2199 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  66.07 
 
 		 557 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  64.44 
 
 		 550 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  62.5 
 
 		 559 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  81.68 
 
 		 583 aa  952    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  63.36 
 
 		 560 aa  678    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  62.82 
 
 		 559 aa  704    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  100 
 
 		 587 aa  1181    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  90.43 
 
 		 585 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  64.5 
 
 		 554 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  70.89 
 
 		 569 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  85.13 
 
 		 587 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  64.26 
 
 		 550 aa  694    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  90.24 
 
 		 585 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  82.74 
 
 		 583 aa  989    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  65.91 
 
 		 576 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  63.41 
 
 		 572 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  63.41 
 
 		 559 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  63.69 
 
 		 559 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  57.63 
 
 		 573 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  54.61 
 
 		 560 aa  614  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  59.96 
 
 		 583 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  55.4 
 
 		 552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  55.04 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  57.3 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  55 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  54.82 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  53.78 
 
 		 556 aa  561  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  52.52 
 
 		 552 aa  553  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  53.91 
 
 		 554 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  53.53 
 
 		 557 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  52.93 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  53.3 
 
 		 554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  53.3 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  52.32 
 
 		 552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  50.8 
 
 		 556 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  49.37 
 
 		 538 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  51.07 
 
 		 546 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  51.17 
 
 		 542 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  49.27 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  49.01 
 
 		 540 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.8 
 
 		 537 aa  505  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  51.71 
 
 		 550 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  49.36 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  46.91 
 
 		 552 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  50.7 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  50.7 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  50.7 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  50.7 
 
 		 609 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  50.7 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  50.7 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  50.7 
 
 		 609 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  48.21 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  46.61 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.09 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  48.21 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  50.09 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  48.03 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  49.12 
 
 		 564 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  49.39 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  46.03 
 
 		 567 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  50.18 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.27 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.93 
 
 		 567 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  50.17 
 
 		 576 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  49.83 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  48.66 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  51.34 
 
 		 559 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  60.4 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  49.91 
 
 		 545 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  50.79 
 
 		 561 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  50 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  48.68 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  49.21 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  50 
 
 		 576 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  49.65 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.85 
 
 		 559 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  49.31 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  50.52 
 
 		 566 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  49.31 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  48.42 
 
 		 565 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  48.51 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  46.57 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  47.13 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.11 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  48.92 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  45.93 
 
 		 542 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  47.99 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  48.75 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  48.75 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  46.5 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.29 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  46.4 
 
 		 544 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  47.99 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  47.43 
 
 		 561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.29 
 
 		 576 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  47.72 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.81 
 
 		 597 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  45.99 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  45.63 
 
 		 545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  45.65 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>