More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3495 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  100 
 
 		 459 aa  893    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  58.86 
 
 		 583 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  60.4 
 
 		 587 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  58.46 
 
 		 583 aa  488  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  60.13 
 
 		 585 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  59.51 
 
 		 585 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  56.42 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  49.89 
 
 		 576 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  48.57 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  49.78 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  46.8 
 
 		 559 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  47.15 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  47.7 
 
 		 559 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  46.46 
 
 		 559 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  45.52 
 
 		 554 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  46.93 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  46.93 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  47.36 
 
 		 560 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  46.24 
 
 		 572 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  40.4 
 
 		 560 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  43.16 
 
 		 556 aa  309  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  42.42 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  43.45 
 
 		 554 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  43.21 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  43.5 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  41.03 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.54 
 
 		 552 aa  279  8e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  40.6 
 
 		 573 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  44.1 
 
 		 583 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  39.33 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  39.78 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  35.84 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  35.84 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  39.74 
 
 		 558 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  35.62 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  34.62 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  35.99 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  34.89 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.04 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  33.78 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  34.27 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  37.14 
 
 		 553 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  34.99 
 
 		 539 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  33.78 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  36.49 
 
 		 542 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  33.78 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  33.78 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  37.19 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  31.52 
 
 		 552 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  38.53 
 
 		 554 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  31.89 
 
 		 561 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  33.71 
 
 		 570 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  35.44 
 
 		 535 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  38.31 
 
 		 554 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  31.67 
 
 		 561 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  30.22 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.14 
 
 		 537 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  35.81 
 
 		 564 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  34.84 
 
 		 539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  35.43 
 
 		 571 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  36.86 
 
 		 546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  35.36 
 
 		 561 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  36.89 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  37.06 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.78 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  32.32 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  32.54 
 
 		 560 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  32.14 
 
 		 573 aa  209  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  32.1 
 
 		 561 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  32.46 
 
 		 566 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  32.51 
 
 		 576 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  34.87 
 
 		 571 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  33.26 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.78 
 
 		 597 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  32.3 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  31.58 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  35.25 
 
 		 546 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  37.61 
 
 		 547 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.92 
 
 		 554 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  33.55 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  35.45 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  31.74 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  33.48 
 
 		 554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  33.26 
 
 		 545 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  33.68 
 
 		 584 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  36.61 
 
 		 564 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  35.49 
 
 		 541 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  34.45 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  35.04 
 
 		 545 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  34.57 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  34.61 
 
 		 572 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  34.01 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  34.81 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.02 
 
 		 577 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  34.99 
 
 		 548 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  35.1 
 
 		 545 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  31.82 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.67 
 
 		 550 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  34.39 
 
 		 572 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  34.39 
 
 		 572 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>