More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1534 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1534  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  100 
 
 
341 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0206  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  82.4 
 
 
341 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  47.34 
 
 
338 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.83 
 
 
334 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.59 
 
 
334 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.35 
 
 
334 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.94 
 
 
333 aa  275  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.663367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2000  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.15 
 
 
333 aa  275  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.13 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0192  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  46.39 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.81 
 
 
335 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.16 
 
 
335 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.23 
 
 
335 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  44.23 
 
 
335 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.56 
 
 
335 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.71 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.87 
 
 
335 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.84 
 
 
335 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.84 
 
 
335 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.56 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  44.82 
 
 
334 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.81 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  41.64 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.96 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.54 
 
 
335 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.12 
 
 
334 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.08 
 
 
335 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5401  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.68 
 
 
335 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.117755  normal  0.0278093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0707  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II (cydB, qxtB)  45.62 
 
 
336 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.27 
 
 
335 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4956  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  44.59 
 
 
335 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.545349  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1421  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.29 
 
 
335 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6408  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.29 
 
 
335 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7067  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.99 
 
 
335 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660644  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3839  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.07 
 
 
335 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.425133  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1769  cyanide-insensitive terminal oxidase  44.21 
 
 
335 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.99 
 
 
335 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0427  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  44.21 
 
 
335 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0170  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.92 
 
 
334 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.81 
 
 
336 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0837  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.9 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2101  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.9 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1836  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.9 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1128  cyanide-insensitive terminal oxidase  43.9 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6551  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.38 
 
 
335 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.24 
 
 
334 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.38 
 
 
335 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  45.14 
 
 
335 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.23 
 
 
332 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0334  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  44.48 
 
 
335 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.38 
 
 
335 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.34 
 
 
335 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3833  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.5 
 
 
336 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3306  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.34 
 
 
335 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4142  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.5 
 
 
336 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5119  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.06 
 
 
333 aa  255  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187118 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.38 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.3 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0741  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.9 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  44.19 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.87 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.35 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5684  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.07 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.77 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.55 
 
 
335 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.55 
 
 
335 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.77 
 
 
335 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.42498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4928  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.11 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000554234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  43.47 
 
 
334 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  41.12 
 
 
329 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5366  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.99 
 
 
335 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4852  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285444  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4819  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.3 
 
 
335 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1811  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  45 
 
 
334 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890434  normal  0.117686 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  40.5 
 
 
329 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0675  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.69 
 
 
347 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5382  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.51 
 
 
335 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5479  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.51 
 
 
335 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779913  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4790  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.51 
 
 
335 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.28 
 
 
335 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2426  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.83 
 
 
331 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0595  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.99 
 
 
336 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  0.217419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  43.67 
 
 
335 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.14 
 
 
338 aa  249  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.01 
 
 
338 aa  248  7e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1965  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  43.25 
 
 
336 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0403  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.25 
 
 
336 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1873  cytochrome oxidase, subunit II  43.25 
 
 
336 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0653973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0702  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.06 
 
 
347 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.68 
 
 
335 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.06 
 
 
347 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0747  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.92 
 
 
335 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00094  ubiquinol oxidase subunit II, cyanide insensitive  40.3 
 
 
333 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.17 
 
 
336 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0417  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  44.31 
 
 
334 aa  245  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2528  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.58 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03150  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  40.18 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73808  normal  0.0133752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3117  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  45.69 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.21 
 
 
336 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>