40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1335 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  82.51 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  79.09 
 
 		 260 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  70.72 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  74.26 
 
 		 237 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  64.91 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  63.74 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  38.93 
 
 		 236 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  39.56 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.56 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  41.8 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  39.04 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  40.41 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  42.63 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.94 
 
 		 183 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  35.59 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  38.64 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  36.47 
 
 		 174 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  34.33 
 
 		 288 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.21 
 
 		 177 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  34.73 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  35.21 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  33.12 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  36.36 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  38.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  38.02 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.93 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  31.79 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.79 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.74 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.37 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  35.71 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1621  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  28.77 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  25.68 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0261  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  26.36 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.62 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1652  chemotaxis protein CheZ  27.17 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00206146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  31.18 
 
 		 220 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>