18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4007 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 976 aa  1933    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  75.88 
 
 		 969 aa  1402    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  29.65 
 
 		 991 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  31.28 
 
 		 728 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.3 
 
 		 830 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.64 
 
 		 841 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  27.01 
 
 		 876 aa  97.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.72 
 
 		 833 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  28.08 
 
 		 832 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  26.7 
 
 		 425 aa  92.8  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.83 
 
 		 792 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.55 
 
 		 719 aa  91.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  27.01 
 
 		 832 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  27.39 
 
 		 765 aa  77.8  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  24.73 
 
 		 747 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  24.52 
 
 		 751 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  30.15 
 
 		 737 aa  45.8  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1009 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>