39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3888 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  89.41 
 
 		 427 aa  756    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  836    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 461 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  21.33 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  23.12 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  21.58 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 532 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  23.18 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.45 
 
 		 525 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>