More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3615 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3615  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 417 aa  843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0520  oxidoreductase domain-containing protein  89.66 
 
 		 416 aa  741    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4191  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 355 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 347 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  22.67 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.01 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  32.11 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  22 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.96 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.11 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.76 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.41 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  21.73 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.01 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.07 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.4 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.4 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.07 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  28.87 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.78 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  26.2 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  22.67 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  21.94 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  21.94 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  21.78 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23.23 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  33.83 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  23.51 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.15 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  23.93 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>