25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1124 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  79.08 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  94.62 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  75.95 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  50.46 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  48.4 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  43.83 
 
 		 793 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  44.73 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  43.82 
 
 		 1159 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  50.36 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  33.33 
 
 		 1597 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  35.44 
 
 		 1708 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.81 
 
 		 4357 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.12 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1699 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  27.27 
 
 		 3907 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.14 
 
 		 2503 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.47 
 
 		 3699 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1504 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.49 
 
 		 3699 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  28.96 
 
 		 2223 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.52 
 
 		 6678 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06323  P150 dynactin NUDM [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0T2]  30.19 
 
 		 1267 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1577 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1916 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>