134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5034 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  100 
 
 		 123 aa  243  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  61.18 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5286  putative signal peptide protein  56.36 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.903888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1645  conserved hypothetical signal peptide protein  56.36 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  63.22 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5354  putative signal peptide protein  63.1 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.02455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  49.6 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  50.4 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  50.47 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  51.55 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  49.04 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  49.04 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  49.04 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  45.38 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  47.79 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  47.79 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  48.41 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  45.28 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  43.48 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  51.4 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  47.75 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  47.75 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  47.71 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  47.47 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  58.21 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  53.75 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  58.82 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  51.9 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  54.17 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  56.06 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  56.06 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  50.63 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  53.73 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  57.58 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  51.32 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  59.15 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  59.15 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  55.71 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  45.37 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  45.37 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  38.26 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  38.26 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  55.22 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  53.52 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  43.52 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  58.46 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  52.17 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  53.12 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  52.31 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  39.81 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  52.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  52.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  52.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  52.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  52.94 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  52.94 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  48.78 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  49.23 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  41.3 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  52.94 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  50.72 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  41.3 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  48.65 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  48.44 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  52.86 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  48.61 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  47.83 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  47.69 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  45.31 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  45.83 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  40.91 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  49.28 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  46.27 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  34.83 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  48.61 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2907  hypothetical protein  46.88 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580394  normal  0.0129637 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  49.06 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  48.44 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  39.73 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  34.78 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  49.06 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  40.35 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  45.59 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  47.17 
 
 		 490 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0168  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 488 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 488 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 487 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 488 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  43.08 
 
 		 486 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  41.79 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  46.15 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  34.67 
 
 		 491 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>