56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3254 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  70.83 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  54.32 
 
 		 91 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  54.43 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  53.09 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  46.53 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  53.16 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  54.43 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  51.9 
 
 		 636 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  51.9 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  51.25 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  54.43 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  44.94 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  53.16 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  46.07 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  53.16 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  48.1 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.02 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.8 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  43.04 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.19 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.86 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  48.57 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  39.73 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.48 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.77 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  36.25 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  34.52 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0893  NTP-binding protein  43.68 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  36.21 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.4 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.37 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3863  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.873271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  34.48 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  36.67 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  32.2 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  32.2 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  32.2 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2767  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314327  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  42.37 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.93 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  43.1 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 104 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 		 109 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>