More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2888 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  100 
 
 		 339 aa  693    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  84.27 
 
 		 341 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  76.06 
 
 		 348 aa  527  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  74.85 
 
 		 350 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  75.45 
 
 		 348 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  74.77 
 
 		 334 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  72.12 
 
 		 339 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  70.91 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  43.37 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  43.67 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  43.07 
 
 		 333 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  42.77 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  44.58 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  44.38 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.09 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  43.24 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  42.77 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  42.9 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  40.61 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  41.03 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.19 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  41.37 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  41.5 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  41.54 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  40.77 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  40.9 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  38.44 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  39.26 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.7 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  40.53 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  39.34 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  37.73 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.12 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  40.11 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  37 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  36.2 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  40.36 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  38.04 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  37.83 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  37.12 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  37 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.76 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  40.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  40.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  40.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  39.2 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  40.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  40.31 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.64 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  37.12 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  40.31 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  40.96 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  37.13 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  33.33 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  40.24 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  40.24 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  36.67 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  37.95 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  37.27 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  39.21 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  39.51 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  40.24 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  35.08 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.44 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  35.22 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  36.25 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  37.5 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  36.06 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  37.32 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  37.32 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  37.32 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  37.32 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  37.32 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  36.57 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  36.25 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  35.88 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  37.31 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  36.31 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  37.35 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  35.82 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  35.82 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0210  luciferase-like  38.51 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  37.5 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  36.36 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  36.5 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  38.11 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  36.7 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  36.7 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>