More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2647 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  70.44 
 
 		 175 aa  233  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  70.44 
 
 		 175 aa  233  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  69.18 
 
 		 176 aa  230  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  66.46 
 
 		 158 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  67.53 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  62.5 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 171 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 167 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  58.28 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 153 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  46.88 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  46.88 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  46.25 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  46.25 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  46.25 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  46.25 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 222 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.25 
 
 		 222 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.65 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.65 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.03 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.38 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>