33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1562 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  82.12 
 
 		 304 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  48.4 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  48.4 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  48.4 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  50.68 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  47.23 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  48.83 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  49.66 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  43.27 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  47.16 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  42.91 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  43.99 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  44.56 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  45.73 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  43.55 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  42.38 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  42.43 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  41.69 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  44.37 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  44.37 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  40.13 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  48.8 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  39.35 
 
 		 199 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  29.86 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  37.8 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  88.89 
 
 		 65 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  26.58 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  67.57 
 
 		 84 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  26.63 
 
 		 399 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  26.7 
 
 		 272 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  23.79 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  25.74 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>