34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2421 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  100 
 
 		 139 aa  266  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2883  PilT protein domain protein  59.09 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.548802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  36.3 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  36.03 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  41.38 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  28.95 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0036  hypothetical protein  26.32 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000398667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  36.09 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  30.83 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  37.61 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  35.82 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  34.85 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.1 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  38.3 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.29 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  30.94 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  33.64 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  32.58 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.69 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.69 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  37.17 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  31.09 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>