More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1825 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.09 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.92 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  34.58 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.37 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.35 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  35.62 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.67 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  33.33 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  34.55 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.22 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.14 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  33.98 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  35.94 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  35.59 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.67 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  34.25 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  34.25 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  37.69 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  31.51 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  31.51 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  35.41 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.44 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  33.98 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  31.74 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  32.58 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.89 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  32.44 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  34.47 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  30.94 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  32.39 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  31.31 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.72 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>