More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0780 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 415 aa  828    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  42.51 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  39.69 
 
 		 441 aa  275  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.74 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  39.63 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.95 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  40.24 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  37.07 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  38.66 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.02 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.29 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  38.19 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  38.72 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  35.43 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.01 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  36.19 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.71 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  37.14 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.94 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.79 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.86 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.86 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  35 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.93 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  31.6 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  34.08 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  34.4 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  32.59 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  34.43 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.7 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.29 
 
 		 508 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.8 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  30.68 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  34.26 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.91 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.84 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  31.44 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.63 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.63 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  33.25 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  33.02 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.8 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  32.91 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  33.99 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 440 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  30.83 
 
 		 496 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 		 462 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  30.57 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  31.37 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.65 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  30.84 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.57 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.1 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.7 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.1 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.32 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.32 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.69 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.69 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  32.32 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  31.59 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  29.54 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  30.93 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.46 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  31.93 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  31.31 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  29.79 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  30.82 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  30.56 
 
 		 422 aa  156  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3626  flagellar hook protein FlgE  30.19 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>