More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5182 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  94.53 
 
 		 403 aa  779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 403 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.72 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.5 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  39.89 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  39.33 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.77 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.55 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.5 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  39.94 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  40.96 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 502 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  41.83 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  37.05 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  37.64 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  39.32 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  39.66 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.83 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  38.51 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.46 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  37.29 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.26 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  37.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  38.22 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  38.27 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  38.51 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  37.08 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  36.8 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  37.29 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.9 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  39.62 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  38.66 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2580  galactonate dehydratase  39.03 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  38.2 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.33 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.78 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.4 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2990  galactonate dehydratase  38.75 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.36 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.75 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  36.16 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  38.51 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  37.85 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  38.51 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  38.51 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2751  galactonate dehydratase  38.46 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.71 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  40.23 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  40.68 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.78 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3772  galactonate dehydratase  38.22 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  37.78 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  37.07 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.59 
 
 		 410 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  36.91 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  36.49 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.2 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  35.83 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  31.96 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.98 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  31.96 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  36.44 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.97 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  38.27 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.97 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.11 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.78 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.74 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.4 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.35 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2579  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.01 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.75 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.37 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.67 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1155  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.15 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.58 
 
 		 386 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  35.11 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  35.11 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.95 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.2 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.64 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.88 
 
 		 382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>