235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4657 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4657  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
309 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2455  hypothetical protein  58.33 
 
 
310 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3336  hypothetical protein  51.02 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0294  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50.68 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00242  hypothetical protein  50.68 
 
 
318 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00245  hypothetical protein  50.68 
 
 
318 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.936924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0329  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  50.34 
 
 
318 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451243  normal  0.871321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3321  protein of unknown function DUF182  50.34 
 
 
318 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1701  hypothetical protein  40.6 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.177535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  35.31 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  35.53 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  33.56 
 
 
337 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.43 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  37.74 
 
 
323 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  33.91 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  32.91 
 
 
318 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  33.22 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  34.66 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.7 
 
 
356 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.52 
 
 
388 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  30.17 
 
 
334 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.66 
 
 
345 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  34.53 
 
 
338 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.29 
 
 
340 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.63 
 
 
381 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  34.83 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.38 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  25.93 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  28.76 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.33 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  27.84 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  30.75 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  28.67 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  29.32 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.17 
 
 
341 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  31.27 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.17 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.27 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  30 
 
 
339 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  28.76 
 
 
312 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  29.34 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.12 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.49 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.49 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  29.43 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.41 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  28.85 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  30.25 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  29.94 
 
 
323 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  30.61 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  27.12 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  29.49 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  30.16 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  27.16 
 
 
373 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  28.66 
 
 
389 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  30 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.48 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  36.84 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  27.87 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  27.46 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  39.35 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  28.2 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  29.73 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.42 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  31.44 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  27.95 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  29.27 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  30.72 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.96 
 
 
233 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  29.8 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  28.62 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  29.03 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.18 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  29.25 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.52 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.31 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  29.03 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  29.03 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.48 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  27.18 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.08 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  26.73 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.08 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.08 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  22.77 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.76 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  30.48 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  27.63 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.85 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  25.97 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  32.11 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  27.71 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.03 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  27.22 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.32 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.32 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  26.67 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.26 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.81 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>