More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3873 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
369 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  95.12 
 
 
369 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  78.73 
 
 
364 aa  577  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  73.91 
 
 
368 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  68.14 
 
 
366 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  68.33 
 
 
365 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  68.33 
 
 
368 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0993  histidinol-phosphate aminotransferase  67.31 
 
 
368 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  60.77 
 
 
392 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  61.73 
 
 
378 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  59.94 
 
 
365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  60.33 
 
 
365 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  63.51 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  59.45 
 
 
365 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 
365 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  57.81 
 
 
365 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  60.77 
 
 
372 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  62.22 
 
 
372 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  57.26 
 
 
365 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5817  histidinol-phosphate aminotransferase  62.98 
 
 
370 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  60.22 
 
 
372 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  57.46 
 
 
365 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  59 
 
 
373 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  54.72 
 
 
371 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  57.7 
 
 
371 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  55.34 
 
 
362 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 
368 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
362 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
361 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  48.9 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
361 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  52.25 
 
 
361 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  46.34 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  45.88 
 
 
368 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  47.34 
 
 
364 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
371 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  45.03 
 
 
360 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  46.26 
 
 
368 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 
373 aa  279  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  46 
 
 
372 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
369 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
369 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
370 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 
371 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  40.62 
 
 
371 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
370 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
369 aa  237  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.09 
 
 
362 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
362 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
386 aa  235  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
358 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
370 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.67 
 
 
370 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  40.16 
 
 
374 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
374 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  36.39 
 
 
372 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
374 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
385 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  39.49 
 
 
376 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  38.42 
 
 
365 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 
364 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
374 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  39.54 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
365 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
374 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
370 aa  222  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  39.34 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
365 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  39.3 
 
 
379 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
365 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
365 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
367 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
370 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.63 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.99 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
363 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
370 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  39.34 
 
 
394 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.67 
 
 
374 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
365 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
373 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
362 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>