37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1261 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  95.39 
 
 		 152 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  72 
 
 		 152 aa  221  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  71.33 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  56.72 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  53.24 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  53.24 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  44.52 
 
 		 180 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  43.84 
 
 		 185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  40.88 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  42.21 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  39.87 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  39.87 
 
 		 179 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  44.08 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  41.79 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  39.1 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  36.23 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  39.1 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  39.1 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  36.18 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  36.76 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  33.12 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.87 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  31.54 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  26.5 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  29.68 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  26.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  20.13 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  26.85 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  26.85 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2847  RDD family membrane protein  36.36 
 
 		 329 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>