170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0130 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  92.75 
 
 
346 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  100 
 
 
348 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  87.5 
 
 
350 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  82.08 
 
 
347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  71.51 
 
 
346 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  71.14 
 
 
345 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  71.72 
 
 
346 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  71.14 
 
 
346 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  70.85 
 
 
346 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  67.93 
 
 
347 aa  494  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  68.22 
 
 
346 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  66.47 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  61.15 
 
 
344 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  61.86 
 
 
344 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  61.54 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  61.02 
 
 
344 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  56.01 
 
 
347 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  56.2 
 
 
352 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  55.75 
 
 
353 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  55.93 
 
 
346 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  55.62 
 
 
352 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  55.33 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  55.33 
 
 
378 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  60.7 
 
 
344 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  55.33 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  55.33 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  55.33 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  55.33 
 
 
352 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  57.96 
 
 
366 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  54.07 
 
 
348 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  54.89 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  53.64 
 
 
355 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  57.51 
 
 
346 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  53.91 
 
 
347 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  54.34 
 
 
354 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  54.34 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  53.91 
 
 
347 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  54.34 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  59.94 
 
 
348 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  56.33 
 
 
364 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  56.33 
 
 
364 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  58.6 
 
 
359 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  53.94 
 
 
348 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  57.23 
 
 
350 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  56.91 
 
 
348 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  55.09 
 
 
347 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  55.72 
 
 
351 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  56.05 
 
 
357 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  52.87 
 
 
354 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  56.59 
 
 
348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  55.36 
 
 
343 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  57.78 
 
 
354 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  57.63 
 
 
349 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  54.25 
 
 
347 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  56.59 
 
 
348 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  56.27 
 
 
348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  57.78 
 
 
364 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  56.78 
 
 
348 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  59.11 
 
 
345 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  54.65 
 
 
344 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  53.96 
 
 
347 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  54.6 
 
 
342 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  57.99 
 
 
355 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  58.01 
 
 
344 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  58.79 
 
 
348 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  56.78 
 
 
348 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  52.48 
 
 
348 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  53.64 
 
 
346 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  54.81 
 
 
347 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  57.14 
 
 
355 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  52.48 
 
 
348 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  52.48 
 
 
348 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  52.19 
 
 
348 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  57.23 
 
 
352 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  57.1 
 
 
348 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  51.74 
 
 
343 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  57.51 
 
 
345 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  54.39 
 
 
340 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  52.94 
 
 
347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  52.94 
 
 
347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  52.94 
 
 
347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  52.79 
 
 
343 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  57.69 
 
 
354 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  55.84 
 
 
343 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  55.42 
 
 
347 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  53.06 
 
 
348 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  52.19 
 
 
348 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  54.95 
 
 
344 aa  364  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  51.45 
 
 
348 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  51.45 
 
 
342 aa  362  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  52.03 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  52.03 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  52.03 
 
 
343 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>