27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1599 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  86.58 
 
 
298 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  52.38 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  47.9 
 
 
283 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  31.23 
 
 
289 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  30.66 
 
 
290 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  26.71 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  28.42 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  28.62 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  27.7 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  25.95 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  26.57 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  26.87 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  26.01 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  27.71 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  25.77 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  26.5 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  29.44 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  28.96 
 
 
270 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  23.91 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  29.63 
 
 
311 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  31.12 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  49.02 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  28.24 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  22.91 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>