47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1362 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  82.91 
 
 		 117 aa  206  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  67.37 
 
 		 99 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  49.09 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  49.09 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  49.09 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  49.09 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  49.09 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  48.04 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  48.35 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  45.54 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  48.42 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  47.13 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  52.86 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  46.67 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  38.54 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  36.17 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  38.1 
 
 		 315 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  35.71 
 
 		 462 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.98 
 
 		 497 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.35 
 
 		 334 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.44 
 
 		 339 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  34.04 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  34.78 
 
 		 406 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  34.78 
 
 		 371 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  34.78 
 
 		 377 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  34.78 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  34.78 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  34.78 
 
 		 418 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  34.78 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  28.75 
 
 		 463 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  31.82 
 
 		 351 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  35.11 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.53 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  30.95 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  29.06 
 
 		 222 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  26.83 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  28.26 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  27.17 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  27.47 
 
 		 280 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>