More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2694 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  46.98 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  46.98 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  46.98 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  47.66 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  46.55 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  46.75 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  47.23 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  46.75 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  47.66 
 
 		 240 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  47.23 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  38.2 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.77 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  39.81 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  34.48 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  34.48 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  35.5 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  34.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  33.05 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  31.6 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  37.56 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.13 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.14 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  30.81 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  35.96 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.11 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  29.48 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  27.03 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.29 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  28.78 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.36 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  25.46 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  29.78 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  29.17 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.65 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  29.38 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  27.75 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  27.47 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.68 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  29.19 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  29.94 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  36.19 
 
 		 511 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.14 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  27.27 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  26.78 
 
 		 282 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  28.04 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.43 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  28.74 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  28.24 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  26.83 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  29.24 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  29.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  33.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  26.22 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  30.46 
 
 		 532 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  34.07 
 
 		 507 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  34 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  31.88 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  33.08 
 
 		 516 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  27.16 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  33.08 
 
 		 505 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  31.85 
 
 		 505 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  24.58 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  28.83 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  29.03 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  31.54 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.67 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  34.07 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  26.42 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  28.46 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  27.09 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.67 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>