71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0395 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  68.75 
 
 		 216 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  60.39 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  60.39 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  58.29 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  57.82 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  57.55 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  57.35 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  57.89 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  59.02 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  56.8 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  56.8 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5192  hypothetical protein  56.28 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  58.57 
 
 		 459 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1157  hypothetical protein  56.28 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 477 aa  201  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  55.92 
 
 		 443 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 437 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  55.56 
 
 		 441 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  55.61 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 406 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  54.76 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  56.54 
 
 		 439 aa  194  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  54.67 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 459 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  55.98 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  54.93 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  54.07 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 446 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  54.9 
 
 		 884 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  55.5 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  54.46 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  55.02 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  55.02 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  54.93 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 468 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  53.33 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  53.11 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  45.12 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  58.05 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  56.63 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  54.73 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  55.3 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  53.11 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  57.95 
 
 		 885 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  57.95 
 
 		 885 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  51.61 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  54.5 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  53.92 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  46.26 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  46.05 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 		 441 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  53.11 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  52.34 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0899  phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  54.29 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2469  dienelactone hydrolase  44.13 
 
 		 239 aa  157  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  51.6 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 		 443 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  38.89 
 
 		 430 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2218  putative phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1968  hypothetical protein  26.7 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.200693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  26.47 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  26.94 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.26 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.69 
 
 		 405 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  27.36 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  32.23 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.89 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>