50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0259 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1166    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  40.68 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  37.44 
 
 		 576 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  35.1 
 
 		 584 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  35 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  30.77 
 
 		 645 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  28.79 
 
 		 867 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  35.28 
 
 		 363 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  34.26 
 
 		 367 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  33.85 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  35.21 
 
 		 249 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  35.98 
 
 		 229 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  35.27 
 
 		 261 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  29.88 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  33.48 
 
 		 254 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 226 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  34.7 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.94 
 
 		 279 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  35.68 
 
 		 245 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  33.8 
 
 		 240 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  32.54 
 
 		 279 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 1848 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1284 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  27 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  30.2 
 
 		 1196 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  27.64 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  29.06 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  26.77 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 1916 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  23.95 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  23.82 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  23 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  25.75 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  33.6 
 
 		 434 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  22.73 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  23.63 
 
 		 427 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  23.24 
 
 		 930 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  19.25 
 
 		 656 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  20.59 
 
 		 650 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  22.63 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  27.1 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  20.64 
 
 		 650 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  26.22 
 
 		 392 aa  47  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  23.25 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  25.45 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  22.97 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 658 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.18 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>