193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5841 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  100 
 
 		 134 aa  259  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  66.17 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  55.47 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  46.79 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  46.79 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  45.45 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  46.9 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  43.93 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  37.6 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  37.39 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  45.13 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  45 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  43.24 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  40.91 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  40.91 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  35.29 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  39.45 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  39.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  38.39 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  38.32 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  41.96 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  38.32 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  40.18 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  41.38 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  35.78 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  35.78 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  36.97 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  38.53 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  42.16 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  42.16 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.78 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  41.18 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  37.74 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  34.86 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  38.02 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  42.34 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  44.64 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.23 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  36.67 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  41.44 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  42.45 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  37.96 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  33.94 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  42.16 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  37.5 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  35.92 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  40.91 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  33.98 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  33.98 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  33.98 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1686  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.961674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  30.22 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  36.73 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  36.73 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  37.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  37.25 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  37.25 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  37.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.51 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  34.31 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.51 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.69 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  34.31 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  33.64 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0708  DoxX  39.32 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.277979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  35.96 
 
 		 379 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  37.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  37.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  37.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  36.84 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  37.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  36.45 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  37.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  33.67 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  43.81 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.79 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.48 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  41.12 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  41.07 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  37.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32.71 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  37.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  37.38 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  36.36 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  36.07 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  37.23 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  33.33 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  40 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  38.32 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1426  DoxD-like family protein  35.78 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.639544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  35.78 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0561  DoxX family membrane protein  35.78 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0464  DoxX family protein  35.78 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.412831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>