35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4421 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  838    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  80.14 
 
 		 435 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25.69 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  20.38 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0358  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  32.26 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3709  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.682847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3766  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3849  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  21.21 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.53 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.53 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  20.37 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.95 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>