32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4140 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1154    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  68.72 
 
 		 540 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  27.99 
 
 		 712 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  26.79 
 
 		 827 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  30.4 
 
 		 708 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  25 
 
 		 723 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  23.15 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  24.23 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  26.86 
 
 		 721 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  28.12 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  24.18 
 
 		 715 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  25.06 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  27.34 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  25.18 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  29.82 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  26.91 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  21.78 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  26.45 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0456  hypothetical protein  31.01 
 
 		 168 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12649  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  31.91 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  28.09 
 
 		 628 aa  47.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  34.17 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  31.82 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  26.65 
 
 		 909 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  26.19 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  26.82 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  26.52 
 
 		 604 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  31.97 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  26.77 
 
 		 679 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  28.85 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  25.12 
 
 		 606 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>