More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2667 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  1005    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3057  ABC transporter related  85.91 
 
 		 505 aa  840    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  58.38 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.74 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.41 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.41 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.41 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.82 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.74 
 
 		 518 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.65 
 
 		 521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.61 
 
 		 524 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.82 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0265  ABC transporter related  41.73 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4113  ABC transporter related  41 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.12 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 		 523 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  39.84 
 
 		 511 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.78 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  37.8 
 
 		 516 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  39.3 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  38.17 
 
 		 513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  39.54 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.13 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.42 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.76 
 
 		 507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.2 
 
 		 499 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  40.12 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  39.09 
 
 		 513 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.5 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.19 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.14 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  37.58 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 525 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38.82 
 
 		 513 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  34.82 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.47 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  38.25 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.15 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 505 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.44 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.22 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  36.17 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  36.17 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  36.17 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.57 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  36.17 
 
 		 516 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  38.88 
 
 		 861 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  36.17 
 
 		 501 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  38.48 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.14 
 
 		 514 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.97 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  37.85 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  35.97 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  35.97 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  37.33 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  35.97 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  35.95 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  37.33 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  35.77 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.4 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 499 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  35.77 
 
 		 501 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 		 500 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  37.01 
 
 		 502 aa  323  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  40.4 
 
 		 497 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  39.76 
 
 		 506 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.92 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  36.29 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.88 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  36.29 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  37.1 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  41.11 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  35.57 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  38.28 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  37.6 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  34.33 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  37.5 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.72 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.45 
 
 		 505 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.83 
 
 		 502 aa  319  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  35.98 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  37.57 
 
 		 585 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  38.72 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.58 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  39.56 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  36.44 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  39.37 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  34.78 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>