More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2434 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
318 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.28 
 
 
318 aa  624  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.08 
 
 
308 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.76 
 
 
318 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.37 
 
 
331 aa  359  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  55.37 
 
 
331 aa  358  5e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
331 aa  358  7e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.03 
 
 
307 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
312 aa  348  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  54.43 
 
 
311 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.62 
 
 
313 aa  335  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  53.8 
 
 
305 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  54.93 
 
 
313 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
318 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.12 
 
 
308 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  55.12 
 
 
306 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  54.43 
 
 
313 aa  330  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.11 
 
 
313 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.9 
 
 
316 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  52.13 
 
 
313 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  55.45 
 
 
302 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.3 
 
 
312 aa  328  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  54.1 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  55.26 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  55.26 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.97 
 
 
309 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  54.43 
 
 
312 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.82 
 
 
311 aa  325  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  52.79 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
308 aa  324  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
313 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
313 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  50.98 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.8 
 
 
311 aa  318  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.8 
 
 
311 aa  318  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  54.55 
 
 
312 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  53.69 
 
 
310 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  316  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  54.15 
 
 
309 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.77 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  54.19 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  51.33 
 
 
315 aa  311  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
310 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
310 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
310 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
313 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
328 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.09 
 
 
324 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  53.65 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  50.99 
 
 
314 aa  305  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  51.95 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  52.16 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  49.52 
 
 
326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  51.17 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.94 
 
 
333 aa  301  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.36 
 
 
307 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
336 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
336 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1373  aspartate carbamoyltransferase  51.14 
 
 
311 aa  299  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  52.52 
 
 
351 aa  299  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
338 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
310 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
334 aa  298  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
306 aa  298  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.53 
 
 
323 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  52.6 
 
 
316 aa  298  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.82 
 
 
334 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
334 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
320 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  49.34 
 
 
307 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  49.38 
 
 
331 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
328 aa  296  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
341 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
343 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
343 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
341 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
305 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
361 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
361 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  48.18 
 
 
309 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
361 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
361 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
320 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
361 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
313 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
315 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
315 aa  295  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
343 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
334 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
334 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
334 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  50.15 
 
 
349 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.12 
 
 
319 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>