27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0733 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  87.16 
 
 		 494 aa  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  100 
 
 		 485 aa  934    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  56.07 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  48.12 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  23.52 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  25.85 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  26.1 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  25 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 503 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.8 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  25 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.87 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  31.08 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.27 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  29.51 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.9 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.06 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  31.01 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  29.51 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  25 
 
 		 537 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  24.11 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>