More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0376 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
267 aa  543  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4606  glycosyl transferase family protein  78.28 
 
 
267 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  57.09 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  52.48 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
249 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  39.92 
 
 
256 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
257 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
253 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  35.83 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
257 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
272 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.4 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.4 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  33.61 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
254 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  33.47 
 
 
256 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
257 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
255 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
256 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 
234 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
247 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
260 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
253 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
252 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
261 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
249 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  36.18 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  26.56 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.97 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
279 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  30.08 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  36.58 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.94 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.47 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.78 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  31.3 
 
 
259 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  34.94 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4045  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
260 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
260 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.62 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  30.83 
 
 
260 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  30.83 
 
 
260 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.69 
 
 
252 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
287 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.54 
 
 
254 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
265 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
535 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
301 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
521 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
250 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  30.89 
 
 
259 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  30.49 
 
 
255 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.99 
 
 
265 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1250  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
270 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188831  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  26.48 
 
 
254 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
257 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
249 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  30.49 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
300 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>