222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3181 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3181  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187841 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1077  putative glycosyltransferase  61.34 
 
 
276 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6295  glycosyl transferase family 2  59.04 
 
 
290 aa  345  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0427  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.43 
 
 
293 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0370  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.43 
 
 
293 aa  195  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3379  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.18 
 
 
295 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  39.72 
 
 
313 aa  192  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
301 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
309 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
313 aa  178  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
295 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  35.69 
 
 
281 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
279 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
288 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3334  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
249 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  30 
 
 
249 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.14 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
259 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
256 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3908  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.078228  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
260 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0566  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277613  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1301  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
256 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  27.97 
 
 
254 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
263 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
255 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
254 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
249 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
250 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
253 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
250 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 
256 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
257 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
250 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
250 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
250 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
250 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
255 aa  102  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
251 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  28.06 
 
 
260 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  28.06 
 
 
260 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  29.39 
 
 
256 aa  102  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
263 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
253 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.5 
 
 
274 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2093  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
282 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  28.52 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  28.52 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
255 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  29.52 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  30.32 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  28.09 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  29.21 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.72 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.72 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.72 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  27.72 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.73 
 
 
255 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  28.08 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.08 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.42 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
258 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
255 aa  92  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  25.66 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>