More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1952 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  52.13 
 
 		 652 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  51.97 
 
 		 652 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 652 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 660 aa  1361    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  53.24 
 
 		 644 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 		 657 aa  698    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 		 666 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  52.35 
 
 		 650 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  52.74 
 
 		 653 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  54.04 
 
 		 651 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  72.46 
 
 		 654 aa  1005    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 		 656 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.32 
 
 		 658 aa  732    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  86.06 
 
 		 660 aa  1207    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  72.12 
 
 		 655 aa  979    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.08 
 
 		 657 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  61.49 
 
 		 657 aa  806    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.95 
 
 		 656 aa  724    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.58 
 
 		 660 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  52.12 
 
 		 653 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  79.85 
 
 		 660 aa  1100    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 		 667 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  58.97 
 
 		 673 aa  773    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 		 666 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  57.6 
 
 		 657 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  55.35 
 
 		 661 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  63.66 
 
 		 653 aa  844    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  55.45 
 
 		 651 aa  729    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.23 
 
 		 656 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.53 
 
 		 646 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  79.39 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  57.84 
 
 		 658 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  50.99 
 
 		 650 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  53.13 
 
 		 649 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 		 650 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  74.09 
 
 		 665 aa  1029    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  51.51 
 
 		 661 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.63 
 
 		 654 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  68.89 
 
 		 654 aa  936    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  76.75 
 
 		 665 aa  1065    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  72.69 
 
 		 658 aa  1035    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  78.6 
 
 		 660 aa  1098    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 		 650 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.22 
 
 		 649 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 		 650 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.82 
 
 		 649 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  79.24 
 
 		 660 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  55.69 
 
 		 658 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  83.79 
 
 		 660 aa  1176    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.93 
 
 		 652 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.67 
 
 		 655 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  77.44 
 
 		 657 aa  1088    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  77.18 
 
 		 633 aa  1027    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  80.12 
 
 		 664 aa  1099    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  80.3 
 
 		 660 aa  1104    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 		 660 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.94 
 
 		 644 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  73.71 
 
 		 664 aa  1023    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 		 651 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  76.1 
 
 		 665 aa  1065    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 		 655 aa  714    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  52.51 
 
 		 650 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  52.51 
 
 		 650 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 645 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  52.64 
 
 		 654 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  55.7 
 
 		 651 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  80.15 
 
 		 660 aa  1103    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  79.36 
 
 		 664 aa  1092    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 		 650 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 		 650 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  51.97 
 
 		 653 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 652 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  80.3 
 
 		 660 aa  1104    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  80.12 
 
 		 664 aa  1099    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49.39 
 
 		 670 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 		 657 aa  701    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  54.13 
 
 		 650 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.12 
 
 		 660 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  54.43 
 
 		 647 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 		 650 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.74 
 
 		 657 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 		 667 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 		 715 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  51.67 
 
 		 653 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 645 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.29 
 
 		 660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  51.75 
 
 		 650 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 		 660 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  51.06 
 
 		 649 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 		 657 aa  693    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  52.22 
 
 		 649 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.16 
 
 		 661 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  76.41 
 
 		 664 aa  1058    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>