159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1585 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  79.17 
 
 		 312 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  76.92 
 
 		 312 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  54.1 
 
 		 299 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  54.63 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  52.1 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  50.81 
 
 		 399 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  52.1 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  52.1 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  51.48 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  50.81 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  50.33 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  49.01 
 
 		 303 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  49.01 
 
 		 303 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  49.19 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  49.84 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  47.23 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  48.45 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  46.23 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  35.53 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  30.46 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  30.64 
 
 		 305 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  29.37 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  29.66 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  28.33 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  26.3 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  27.95 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  27.72 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  24.57 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  27.11 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  27.11 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  24.76 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  25.85 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  24.18 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  24.51 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  31.66 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  27.37 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  28.2 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  24.18 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  27.9 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  25 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  24.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  24.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  24.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  24.1 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  31.61 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  23.96 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  30.97 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  24.17 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  24.43 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  36.55 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  22.7 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  25.89 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  25.42 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  23.86 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  23.26 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  23.87 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  22.85 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  22.74 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  28.85 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  26.67 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  24.76 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  21.5 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  23.18 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  26.9 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  30.87 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  26.46 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  28.88 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  25.9 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1463  hypothetical protein  26.39 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.838537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1391  aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  24.31 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  22.26 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  25.67 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  25.95 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  23.22 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4821  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  27.94 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.09 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5516  aldose 1-epimerase  31.82 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  24.39 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  24.76 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  28.04 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  21.63 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3975  aldose 1-epimerase  29.87 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  25.36 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  23.62 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  27.53 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  28.43 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  29.66 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2216  Aldose 1-epimerase  27.52 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>