47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3429 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  98.2 
 
 		 612 aa  1206    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1237    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  39.45 
 
 		 277 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.84 
 
 		 562 aa  180  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2415  hypothetical protein  35.96 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0798  hypothetical protein  38.59 
 
 		 952 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.42 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.77 
 
 		 302 aa  163  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  35.59 
 
 		 297 aa  160  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.59 
 
 		 288 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 		 1316 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.71 
 
 		 612 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.3 
 
 		 907 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 		 979 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  34.23 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.73 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  25.81 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.72 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.06 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.9 
 
 		 265 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.65 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2712  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.348645  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  28.48 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.48 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  30.26 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.67 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  33.12 
 
 		 438 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.77 
 
 		 658 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  29.85 
 
 		 322 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 		 654 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 		 305 aa  47.4  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 301 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.08 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  31.82 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 		 285 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  39.66 
 
 		 616 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.19 
 
 		 805 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.63 
 
 		 463 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 		 711 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 		 850 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>