More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3081 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  70.37 
 
 		 582 aa  805    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  62.08 
 
 		 572 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.2 
 
 		 571 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.2 
 
 		 571 aa  736    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 571 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  61.2 
 
 		 571 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  61.38 
 
 		 571 aa  741    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  61.38 
 
 		 571 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  60.67 
 
 		 571 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  63.14 
 
 		 576 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 		 567 aa  1129    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  68.31 
 
 		 584 aa  780    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.73 
 
 		 571 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.2 
 
 		 571 aa  736    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  62.08 
 
 		 572 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  67.73 
 
 		 568 aa  792    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  62.08 
 
 		 572 aa  753    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  64.37 
 
 		 572 aa  765    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 571 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  71.13 
 
 		 582 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  74.38 
 
 		 565 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  78.23 
 
 		 566 aa  892    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  65.26 
 
 		 572 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  70.37 
 
 		 582 aa  804    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  99.47 
 
 		 567 aa  1127    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  70.77 
 
 		 610 aa  810    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.48 
 
 		 567 aa  1010    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  52.03 
 
 		 572 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  44.37 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  43.74 
 
 		 579 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  45.22 
 
 		 636 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  43.13 
 
 		 582 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  40.6 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.24 
 
 		 596 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  43.99 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  46.84 
 
 		 575 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  46.84 
 
 		 612 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  47.9 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 575 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  37.59 
 
 		 589 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.32 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  39.52 
 
 		 597 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.58 
 
 		 598 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.29 
 
 		 597 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.38 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.04 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.04 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.65 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  40.85 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.66 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.51 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  41.02 
 
 		 584 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.74 
 
 		 601 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  40.29 
 
 		 550 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.26 
 
 		 575 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.04 
 
 		 617 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.37 
 
 		 586 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  40.73 
 
 		 586 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.05 
 
 		 556 aa  359  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  39.51 
 
 		 582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  38.26 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.32 
 
 		 578 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.28 
 
 		 586 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.08 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  39.41 
 
 		 597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  39.88 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.88 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.88 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  40.58 
 
 		 578 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.33 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  41.73 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  39.04 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  39.68 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.52 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  39.83 
 
 		 580 aa  350  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 611 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  37.73 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.94 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  37.73 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.73 
 
 		 610 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  41.75 
 
 		 611 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  41.6 
 
 		 611 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 614 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.25 
 
 		 575 aa  345  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  36.21 
 
 		 602 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.4 
 
 		 591 aa  342  9e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.73 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 620 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.28 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  37.38 
 
 		 644 aa  340  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.06 
 
 		 600 aa  340  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.03 
 
 		 601 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.72 
 
 		 609 aa  339  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>