More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2905 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  99.64 
 
 		 278 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  92.81 
 
 		 278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  77.45 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  77.34 
 
 		 282 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  74.46 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  72.92 
 
 		 280 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  62.13 
 
 		 281 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 274 aa  321  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  60.57 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  59.5 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 275 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  59.14 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 		 287 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  60.14 
 
 		 285 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  59.85 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  59.85 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  55.71 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 		 296 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  58.72 
 
 		 291 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  59.36 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  59.12 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 		 297 aa  291  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  58.48 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  56.23 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  54.84 
 
 		 287 aa  285  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  56.62 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  56.12 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  55 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  56.46 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  54.68 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  55.04 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  54.32 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  51.64 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  55.97 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  58.09 
 
 		 272 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  53.16 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  41.47 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  34.06 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  43.28 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  41.98 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.6 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  44.62 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.41 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.18 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  34.53 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  41.92 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  34.52 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>