35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1876 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  345  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  97.73 
 
 		 176 aa  316  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  80.95 
 
 		 169 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  45.76 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  49.08 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  44.57 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  47.73 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  30.12 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  23.93 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  27.52 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  27.56 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  26.42 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.79 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  26.71 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  25.87 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  26.57 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  26.57 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  28.19 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  28.66 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  27.52 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  31.19 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  25.32 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  26.58 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  25.73 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.21 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  23.87 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  23.87 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  23.53 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  24.22 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  24.2 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  29.38 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  28.19 
 
 		 166 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>