More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1057 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  88.94 
 
 
470 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  100 
 
 
470 aa  918    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  99.36 
 
 
470 aa  913    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  60.3 
 
 
471 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  62.55 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  60.77 
 
 
470 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.19 
 
 
474 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.64 
 
 
475 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  46.68 
 
 
714 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  46.46 
 
 
714 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  51.26 
 
 
477 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.21 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.92 
 
 
473 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.02 
 
 
475 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.36 
 
 
475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.58 
 
 
472 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.55 
 
 
472 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.01 
 
 
482 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.09 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45 
 
 
473 aa  325  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.3 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  43.67 
 
 
507 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.38 
 
 
486 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  41.05 
 
 
704 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  40.95 
 
 
515 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.91 
 
 
494 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  41 
 
 
720 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  41.79 
 
 
508 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.79 
 
 
482 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.85 
 
 
508 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  40.48 
 
 
510 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  39.87 
 
 
516 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.98 
 
 
472 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.48 
 
 
712 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  41.7 
 
 
507 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.74 
 
 
713 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  41.58 
 
 
509 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.77 
 
 
717 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.27 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  43.45 
 
 
513 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.79 
 
 
717 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  36.6 
 
 
713 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  36.81 
 
 
717 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  39.96 
 
 
722 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  41.14 
 
 
510 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.47 
 
 
482 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.61 
 
 
507 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.53 
 
 
722 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.44 
 
 
746 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.44 
 
 
515 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  36.27 
 
 
716 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  41.45 
 
 
525 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  35.78 
 
 
738 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  41.9 
 
 
505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.68 
 
 
722 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.88 
 
 
484 aa  269  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  36.05 
 
 
716 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  34.06 
 
 
532 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.56 
 
 
705 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.68 
 
 
520 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.82 
 
 
459 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.43 
 
 
456 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.11 
 
 
546 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.11 
 
 
546 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  36.73 
 
 
457 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.14 
 
 
459 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.65 
 
 
489 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.74 
 
 
546 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  35.24 
 
 
504 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.71 
 
 
460 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  31.86 
 
 
489 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  35.75 
 
 
548 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.01 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  30.8 
 
 
499 aa  223  8e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.85 
 
 
460 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.63 
 
 
546 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.65 
 
 
460 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
450 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  33.11 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  33.26 
 
 
458 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.73 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  34.01 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.28 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  33.41 
 
 
448 aa  213  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  33.64 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.46 
 
 
459 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
585 aa  213  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  34.46 
 
 
459 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.46 
 
 
590 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.71 
 
 
745 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  34.06 
 
 
550 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.98 
 
 
557 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  31.8 
 
 
464 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  33.03 
 
 
458 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  36.76 
 
 
481 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>