49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02587 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1036    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  50.98 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  50.98 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  30.67 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  34.63 
 
 		 602 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  40.76 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  40.76 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  32.78 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  32.72 
 
 		 598 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  33.39 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  33.39 
 
 		 590 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  37.94 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  37.94 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  31.9 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  32.08 
 
 		 597 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  31.73 
 
 		 649 aa  170  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  32.08 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  32.08 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  32.08 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  31.73 
 
 		 740 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  32.73 
 
 		 603 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  31.43 
 
 		 563 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  33.39 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  30.03 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  29.67 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  27.87 
 
 		 556 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  26.78 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.36 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  29.08 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  27.21 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  30.62 
 
 		 717 aa  94.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  31.05 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  31.3 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  29.05 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  28.13 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  32.13 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  29.43 
 
 		 672 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  25 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  29.24 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  28.97 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  28.39 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  30.93 
 
 		 573 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  25.53 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>