38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1818 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  87.69 
 
 		 265 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  79.92 
 
 		 263 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  75 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  52.21 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  54.72 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  52.23 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  47.88 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.94 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  47.44 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  45.49 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  47.53 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  44.63 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  46.4 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  34.35 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  35.82 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  37.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  33.19 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  30.81 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  30 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33438  predicted protein  33.33 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.163153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.22 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  29.44 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  27.75 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  29.35 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.69 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.17 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.95 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  28.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  39.08 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  32.41 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  24.1 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  26.24 
 
 		 240 aa  42  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>