44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1449 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  100 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  86.01 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  80.42 
 
 		 143 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  74.29 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  59.03 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  56.3 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  52.31 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  45.74 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  32.37 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  34.11 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  34.11 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  29.32 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  32.48 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  31.62 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  34.55 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  32.46 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  29.06 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  29.06 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  26.5 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  27.27 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  29.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  26.98 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  26.19 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  26.5 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  28.93 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  32.14 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  27.78 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  28.7 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  27.5 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  27.5 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  29 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  26.55 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  23.85 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  25.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  29.36 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  24.79 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  28.83 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  28.83 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  28.83 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  25.96 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  30.14 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  24.04 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  22.96 
 
 		 163 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>