30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0476 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  100 
 
 		 697 aa  1288    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  86.3 
 
 		 306 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  82.89 
 
 		 617 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  73.38 
 
 		 727 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  65.56 
 
 		 663 aa  439  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  58.82 
 
 		 723 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 		 717 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  57.48 
 
 		 718 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  56.31 
 
 		 666 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  58.02 
 
 		 624 aa  313  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  56.35 
 
 		 348 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  44 
 
 		 880 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  42.29 
 
 		 742 aa  234  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  44.36 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  40.86 
 
 		 739 aa  225  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  40.36 
 
 		 742 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 703 aa  219  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 711 aa  197  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.43 
 
 		 701 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.43 
 
 		 701 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 730 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 208 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  64.52 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.46 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  38.05 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 217 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  31.21 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>