43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4723 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  75 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  72.03 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  73.46 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  70.72 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  77.45 
 
 		 237 aa  360  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  67.8 
 
 		 259 aa  352  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  41.54 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  48.13 
 
 		 236 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.11 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  36.5 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.5 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.88 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  45.14 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  42.01 
 
 		 183 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  32.71 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  35.2 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  35.5 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.63 
 
 		 177 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  37.58 
 
 		 440 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  32.84 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  34.21 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  37.4 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  35.93 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  35.93 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  32.61 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.61 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.3 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.94 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  34.94 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  32 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2017  chemotaxis regulator CheZ  34.41 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3047  chemotaxis phosphatase, CheZ  28.87 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0783794 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  30.87 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  28.97 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3028  chemotaxis phosphatase, CheZ  34.57 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2452  chemotaxis regulator CheZ  30.68 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2605  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1861  chemotaxis regulator CheZ  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  30.11 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3695  chemotaxis regulator CheZ  32.05 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0568116  normal  0.0208475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02868  chemotaxis protein cheZ  22.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>